宗教法人法の２条に、「宗教団体」の定義が定められています。
１号で被包括宗教団体について、２号で包括宗教団体について定められています。
包括と被包括の関係は、本山と末寺との関係とは必ずしも同じ概念ではなく、
直ちに支配や制約等を意味するものでもないそうです。
包括と被包括の関係は（上下関係ではなく）対等な関係で、その具体的な内容は、包括宗教団体と被包括宗教団体との間の取り決めで決定されます（宗教法人法１２条１項１２号等参照）。
（『宗教法人の管理運営の手引 第二集 宗教法人の事務』（文化庁）３頁、『寺院法務の実務と書式』（庄司道弘、本間久雄、粟津大彗）４９頁参照）
実際には、長い歴史のある宗教団体の場合には、本山が包括宗教団体で、取り決めの内容もある程度伝統的に決まっているのではないか、と思われます。